Die meißten mikroskopischen Fotos werden mit einem nicht unerheblichen Aufwand nachbearbeitet. Ziel dieser Arbeiten ist ein höherer Kontrast, höhere Schärfe, ausgewogenerer Weißabgleich, höhere Schärfentiefe, geringeres Rauschen und das Zusammensetzen großer Bilder aus mehreren kleinen Bildern. Nicht unerwähnt darf das 'Bilderputzen' bleiben. Dabei sollen Objekte, die nicht im Zusammenhang mit dem Motiv stehen, entfernt oder verrauscht werden, ohne das eigentliche Motiv zu verändern. Beispielsweise werden so Staub oder Sandkörner entfernt oder maskiert.

Für diese Zwecke ist eine ganze Reihe von Software auf dem Markt erhältlich. Dabei reicht das Angebot von kostenloser Software über Shareware und kostenpflichtige Profi-Software. Die hier eingesetzte Software wird unter den folgenden Links beschrieben:

• das Entrauschen


• das Stacken


• das Stitchen


• das 'Putzen'